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A Liga foi fundada por iniciativa do Professor Ananais Pereira da Silva, que foi o primeiro presidente, juntamente com amigos e políticos da época. Seu primeiro nome foi Liga Anapolina de Futebol, denominação que durou até a mudança em 1962, passando a se chamar Liga Anapolina de Desportos.

Até 1960 e a partir de 1965, só foram organizados campeonatos amadores. Segundo o pesquisador Gerson Rodrigues, de 1961 a 1964, havia também títulos profissionais, vencidos pelo Ipiranga AC. Na tabela abaixo, o campeão e o vice de 1963 são profissionais.
Não se confunde com a Taça Cidade de Anápolis, disputada por times profissionais e conquistada por Anápolis (1966, 1967 e 2011), Ipiranga (1968 e 1972) e Anapolina (1980 e 1984).
Obs: nos campeonatos da Liga, “Taça Cidade de Anápolis” é a primeira fase do campeonato amador.

Entre os clubes que disputam ou disputaram a Liga Amadora de Anápolis e que se profissionalizaram estão: Anápolis Futebol Clube (Anápolis), Associação Atlética Alexaniense (Alexânia), Associação Atlética Anapolina (Anápolis), Ipiranga Atlético Clube (Anápolis), Manchester Futebol Clube (Anápolis) e Pires do Rio Futebol Clube (Pires do Rio).
Obs: Clubes de outras cidades podem se filiar à Liga.
L.P.E.C. é a sigla de Liderança Profissional Esporte Clube.
(*) O União Esportiva Operária mudou seu nome para Anápolis Futebol Clube em 1951.

Campeonato Municipal de Anápolis - 1ª Divisão
Ano Campeão Vice
2020 Guarani FC de Pirenópolis Novo Paraíso FC
2019 Anatex EX Goianápolis FC
2018 Santa Cruz EC Força Jovem FC
2017 Anatex EC Força Jovem FC
2016 Alexaniense Goianápolis FC
2015 Goianápolis FC AA Alexaniense
2014 EC Avai AA Alexaniense
2013 Goianápolis FC EC Avai
2012 EC Avai FC Funerária
2011 L.P.E.C. EC Avai
2010 EC Funeraria Sonnus CFC
2009 EC Avai AA Corumbaense
2008 AE Bairro de Lourdes União Neropolina de Esportes
2007 Goianápolis FC Anatex FC
2006 AA Anapolina Santa Isabel EC
2005 Anatex FC EC Avaí
2004 Santa Isabel EC SE Anápolis
2003 SE Anápolis Araguaia EC
2002 SE Anápolis Anatex FC
2001 Goianápolis FC Araguaia EC
2000 Araguaia EC Novo Paraíso FC
1999 Anatex FC União EC
1998 Novo Paraíso FC Anatex FC
1997 Anatex FC AA Anapolina
1996 Metal Forte FC Anatex FC
1995 Goianápolis FC Anatex FC
1994 União EC Goianápolis FC
1993 EC Avaí Araguaia EC
1992 EC Avaí EC Anhanguera
1991 EC Anhanguera Goianápolis FC
1990 EC Anhanguera EC Avaí
1989 Goianápolis FC Santa Isabel EC
1988 EC Avaí Mago FC
1987 EC Anhanguera Operário FC
1986 União EC Goianápolis FC
1985 EC Anhanguera Anatex FC
1984 Brahma EC Goianápolis FC
1983 Brahma EC EC Anhanguera
1982 ADC Cemina Brahma EC
1981 Vila Góis EC Ipiranga AC
1980 ADC Cemina Anatex FC
1979 ADC Cemina Goianápolis FC
1978 EC Anhanguera Vila Góis EC
1977 Anatex FC Flamengo FC
1976 EC Anhanguera Flamengo FC
1975 Ipiranga AC Mago FC
1974 Araguaia EC Goianápolis FC
1973 Maracanã EC EC Santa Maria
1972 Mago FC Maracanã EC
1971 Mago FC Maracanã EC
1970 União EC Vila Góis EC
1969 Vila Góis EC Maracanã EC
1968 Ipiranga AC Anápolis FC
1967 Anhanguera EC Flamengo FC
1966 Flamengo FC Vila Góis EC
1965 União EC Maracanã EC
1964 Vila Góis EC EC Santa Maria
1963 Ipiranga AC Araguaia EC
1962 União EC Anatex EC
1961 Vila Góis EC Maracanã EC
1960 AA Anapolina Flamengo FC
1959 Ipiranga AC Anápolis FC
1958 Anápolis FC Ipiranga AC
1957 Ipiranga AC Anápolis FC
1956 AA Anapolina São Francisco EC
1955 São Francisco EC AA Anapolina
1954 Anápolis FC Castilhos EC
1953 São Francisco EC AA Anapolina
1952 AA Anapolina Anápolis FC
1951 AA Anapolina São Francisco EC
1950 AA Anapolina União Operária (*)
1949 AA Anapolina São Francisco EC

Fontes: www.ligaanapolina.com.br, http://arubraexata.vilabol.uol.com.br, www.anapolisfc.com.br, www.webcup.com.br, historiadofutebol.com, www.futebolgoiano.com.br, www.futeboldegoyaz.com.br e Arquivo www.campeoesdofutebol.com.br.

Pesquisas de Laércio Becker, de Curitiba-PR; e Sidney Barbosa da Silva.
Página adicionada em 14/Fevereiro/2009; e atualizada em 09/Outubro/2021.