A fundação
O Club Deportivo Águila foi fundado em quinze de fevereiro de 1926, no bairro de San Felipe, na cidade de San Miguel, por um grupo de de 10 jovens, cujo primeiro presidente foi Victor Vanegas, para promover inicialmente o Beisebol, depois o futebol e finalmente o basquete.

A prática do Beisebol e do futebol não tiveram o êxito desejado fazendo com que a diretoria viesse a se dedicar a prática do basquete. Esporte pelo qual teve-se êxito nacional e até internacional.

O futebol
Em 1956, um grupo de associados se reuniram e resolveram investir "pesado" na formação de uma equipe de futebol dentro do clube, tanto que, o futebol dentro do clube, segundo Decreto do Diario Oficial, nasceu em 26 de junho de 1956. Esses associados ficaram com a responsabilidade econômica para manter o time de futebol e formaram uma primeira junta diretiva formada pelo Dr Miguel Charlaix (Presidente); Dr José Estrada, Dr Godofredo Lahúd; Don Ulises Calderón Velasco; Don Ernesto Schaeufler; Don Oscar Humberto Quiróz; e Don José Rogelio Pocasangre. Essa Junta diretiva adquiriu a equipe do Alacranes FC que já jogava na categoria B do futebol salvadorenho, jogando com este nome o torneio de 1956 - somente em 1957 passou a jogar como CD Aguila.

Em 1957, o Aguila, jogou a zona Oriental do campeonato de El Salvador contra o Club Municipal Limeño, para se definir o representante que disputaria uma partida extra com o Atlético Constancia, de San Salvador. O ganhador da partida, no caso o Aguila, ganharia o direito de subir a principal categoria B do futebol nacional.

O CD Aguila é a segunda equipe com maior numero de conquistas em El Salvador. Em 1968 conquistou a Copa Charlaix, taça que era entregue ao clube que vencesse três campeonatos consecutvos ou cinco alternadas - um dos grandes responsáveis pela conquista deste ano foi o técnico brasileiro Silas da Silva.

Estádio Juan Francisco Barraza
Este estádio é alugado pelo clube e foi inaugurado no ano de 1963 e levava o nome de Estadio Migueleño. Foi rebatizado em 1968 para Estádio Juan Francisco Barraza, nome de um dos maiores jogadores do clube (já falecido). Atualmente está cedido em forma de "Comodato" para a Fundação Aguila (que não tem nenhuma relação com o clube de futebol).
Capacidade: 10.000 espectadores