Com a criação da Copa União em 1987, vários clubes de regiões menos populares que entravam no Campeonato Brasileiro por ser campeão estadual, deixaram de enfrentar os chamados "grandes" e com isso algumas agremiações corriam o risco até de fechar as portas. A solução foi criar uma "Copa" nos moldes dos europeus.
Em 1989, na gestão de Ricardo Teixeira, a CBF cria a chamada Copa do Brasil, que permitia a entrada de clubes de todos os estados.
Equipe do Grêmio que conquistou a primeira edição da Copa do Brasil - 1989
Inicialmente todos os campeões estaduais e mais os vices de alguns estados com melhor representação nacional, jogavam partidas de forma eliminatórios, num total de 32 equipes.
É a segunda competição de clubes do país em importância, e tem um formato de eliminatórias diretas, em que os times se enfrentam em confrontos de ida e volta até que um campeão seja decidido.
Ao longo do tempo o sistema de disputa teve algumas alterações. Em 1995 ficou estabelecido que nas duas primeiras fases, a equipe que vencesse por três gols ou mais de diferença, na casa do adversário (jogo de ida), não precisaria disputar a segunda partida. No ano seguinte esta diferença caiu para dois gols. Este modelo de eliminação permaneceu até a edição 2016.
A partir de 2017 a fase ocorre em jogo único, sendo que o clube visitante joga pelo empate e o mandante precisa vencer para avançar. A segunda fase também é disputada por jogo único, entretanto o empate leva a decisão para os pênaltis.
Durante os anos de 1989 a 1993, o campeão ficava de posse definitiva da taça. A partir de 1994 só quem ficava com o troféu de forma definitiva seria a equipe que vencesse a competição por três vezes. Neste sistema, só o Grêmio teve a posse do troféu, nas conquistas de 1994, 1997 e 2001.
Após a conquista gremista de 2001, foi colocado um novo troféu em disputa. Mas nenhum clube conseguiu ficar com a posse do mesmo, já que em 2008, um novo foi posto em disputa.
No ano de 2009 foi introduzido o nome do patrocinador ao da competição, e a Copa do Brasil passou a ser conhecida, também, pelo seu naming rights:
2009–2012: Kia Motors (Copa Kia do Brasil)
2013: Perdigão (Copa Perdigão do Brasil)
2014–2015: Sadia (Copa Sadia do Brasil)
2016–2020: Continental (Copa Continental do Brasil)
2021–2022: Intelbras (Copa Intelbras do Brasil)
2023-2024: Betano (Copa Betano do Brasil)
Apesar das grandes dificuldades de clubes de menor expressão avançar a proxima fase, o que eles querem mesmo é poder enfrentar os chamados "Grandes" para atrair público e renda.
Atualmente, o campeão da competição garante vaga na Copa Libertadores e na disputa da Supercopa do Brasil.
Dados históricos
1. O primeiro gol da história da Copa do Brasil foi marcado por Alcindo, na vitória por 2 a 0 do Flamengo sobre o Paysandu, em 19 de julho de 1989.
2. Fred, ex-Fluminense e Atlético-MG, é o maior artilheiro da história da Copa do Brasil, fez 37 gols, segundo dados oficiais da CBF. O craque Romário é o segundo jogador que mais gols fez ao longo da história da competição, foram 36 gols em 47 partidas; o primeiro foi no ano de 1995 e o último em 2007. Depois vem Gabigol, ou Gabi, ou Gabriel Barbosa (vários apelidos), com 32 gols, o último deles pelo Flamengo na final 2024.
Em seguida vem Viola (29 gols em 44 jogos), Oséas (28 gols em 53 jogos) e Paulo Nunes (28 em 58 partidas), que encerraram suas carreiras.
3. Carlos Miguel e Zinho são os jogadores que mais participaram da Copa do Brasil; cada um jogou 71 partidas.
4. O Atlético Mineiro é o detentor da maior goleada: em 28 de fevereiro de 1991, surrou a equipe piauíense do Caiçara, em Belo Horizonte, pelo placar de 11 a 0. A segunda maior goleada foi em 28 de março de 2001, São Paulo 10 x 0 Botafogo/PB; e 10 de março de 2010, Santos 10 x 0 Naviraiense/MS.
5. Clubes campeões invictos:
Grêmio (1989/1994/1997); Cruzeiro (2000/2003); Palmeiras (2012/2020); Corinthians (1995); Criciúma (1991) e Flamengo (1990).
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